Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN67

PCDHB10, Protocadherin beta-10, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB10Q9UN67 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB10Q9UN67 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB10Q9UN67 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB10Q9UN67 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB10Q9UN67 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB10Q9UN67 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB10Q9UN67 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB10Q9UN67 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms