Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP2Q9ULQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP2Q9ULQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STRIP2Q9ULQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRIP2Q9ULQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRIP2Q9ULQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRIP2Q9ULQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms