Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRID1Q9ULK0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRID1Q9ULK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRID1Q9ULK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRID1Q9ULK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRID1Q9ULK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GRID1Q9ULK0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRID1Q9ULK0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms