Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFY2Q9P0M6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFY2Q9P0M6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFY2Q9P0M6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2AFY2Q9P0M6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2AFY2Q9P0M6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFY2Q9P0M6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms