Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKIRAS2Q9NYR9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKIRAS2Q9NYR9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKIRAS2Q9NYR9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKIRAS2Q9NYR9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS2Q9NYR9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms