Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRMT1Q9NXH9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRMT1Q9NXH9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRMT1Q9NXH9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRMT1Q9NXH9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRMT1Q9NXH9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRMT1Q9NXH9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRMT1Q9NXH9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRMT1Q9NXH9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRMT1Q9NXH9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRMT1Q9NXH9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRMT1Q9NXH9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRMT1Q9NXH9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRMT1Q9NXH9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms