Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNAJC17Q9NVM6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNAJC17Q9NVM6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNAJC17Q9NVM6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJC17Q9NVM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJC17Q9NVM6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJC17Q9NVM6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms