Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS45Q9NRW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS45Q9NRW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS45Q9NRW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS45Q9NRW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS45Q9NRW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms