Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA2

SLC17A5, Sialin, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A5Q9NRA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A5Q9NRA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A5Q9NRA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A5Q9NRA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC17A5Q9NRA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC17A5Q9NRA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC17A5Q9NRA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms