Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL1Q9NR64 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL1Q9NR64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL1Q9NR64 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL1Q9NR64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL1Q9NR64 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms