Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM36Q9NQ86 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM36Q9NQ86 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM36Q9NQ86 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM36Q9NQ86 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM36Q9NQ86 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms