Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM138Q9NPI0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM138Q9NPI0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM138Q9NPI0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM138Q9NPI0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM138Q9NPI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM138Q9NPI0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms