Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBM6

TAF9B, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9BQ9HBM6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF9BQ9HBM6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF9BQ9HBM6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF9BQ9HBM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF9BQ9HBM6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF9BQ9HBM6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF9BQ9HBM6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF9BQ9HBM6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.1 ms