Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCPEP1Q9HB40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCPEP1Q9HB40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCPEP1Q9HB40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCPEP1Q9HB40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCPEP1Q9HB40 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms