Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLK4Q9HAZ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLK4Q9HAZ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLK4Q9HAZ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLK4Q9HAZ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLK4Q9HAZ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLK4Q9HAZ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLK4Q9HAZ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK4Q9HAZ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK4Q9HAZ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK4Q9HAZ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK4Q9HAZ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms