Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FKRPQ9H9S5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FKRPQ9H9S5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FKRPQ9H9S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FKRPQ9H9S5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms