Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W4

PLEKHF2, Pleckstrin homology domain-containing family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF2Q9H8W4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLEKHF2Q9H8W4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLEKHF2Q9H8W4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLEKHF2Q9H8W4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLEKHF2Q9H8W4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLEKHF2Q9H8W4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms