Protein–RNA interactions for Protein: Q9H426

RIMS4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS4Q9H426 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS4Q9H426 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS4Q9H426 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS4Q9H426 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIMS4Q9H426 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS4Q9H426 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS4Q9H426 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS4Q9H426 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms