Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA6AQ9H2E6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA6AQ9H2E6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA6AQ9H2E6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6AQ9H2E6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6AQ9H2E6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6AQ9H2E6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6AQ9H2E6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6AQ9H2E6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6AQ9H2E6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6AQ9H2E6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6AQ9H2E6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6AQ9H2E6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms