Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GFRA4Q9GZZ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GFRA4Q9GZZ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GFRA4Q9GZZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GFRA4Q9GZZ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
GFRA4Q9GZZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA4Q9GZZ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms