Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC11CQ9BY50 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC11CQ9BY50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC11CQ9BY50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC11CQ9BY50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC11CQ9BY50 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC11CQ9BY50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC11CQ9BY50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms