Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA9Q9BWV2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA9Q9BWV2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA9Q9BWV2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATA9Q9BWV2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATA9Q9BWV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA9Q9BWV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA9Q9BWV2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms