Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC106Q9BWC9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC106Q9BWC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC106Q9BWC9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC106Q9BWC9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC106Q9BWC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC106Q9BWC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms