Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTRCQ99895 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTRCQ99895 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTRCQ99895 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTRCQ99895 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTRCQ99895 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTRCQ99895 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms