Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MTRQ99707 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MTRQ99707 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MTRQ99707 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MTRQ99707 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MTRQ99707 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MTRQ99707 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MTRQ99707 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MTRQ99707 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTRQ99707 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTRQ99707 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTRQ99707 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MTRQ99707 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MTRQ99707 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MTRQ99707 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MTRQ99707 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTRQ99707 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTRQ99707 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTRQ99707 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTRQ99707 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTRQ99707 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTRQ99707 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTRQ99707 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTRQ99707 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTRQ99707 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MTRQ99707 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTRQ99707 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MTRQ99707 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
MTRQ99707 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MTRQ99707 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTRQ99707 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTRQ99707 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTRQ99707 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTRQ99707 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTRQ99707 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTRQ99707 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTRQ99707 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTRQ99707 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MTRQ99707 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTRQ99707 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MTRQ99707 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MTRQ99707 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTRQ99707 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTRQ99707 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTRQ99707 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTRQ99707 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MTRQ99707 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTRQ99707 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTRQ99707 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MTRQ99707 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTRQ99707 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTRQ99707 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MTRQ99707 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTRQ99707 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTRQ99707 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MTRQ99707 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTRQ99707 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTRQ99707 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTRQ99707 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTRQ99707 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTRQ99707 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTRQ99707 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTRQ99707 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTRQ99707 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MTRQ99707 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTRQ99707 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTRQ99707 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTRQ99707 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTRQ99707 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTRQ99707 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MTRQ99707 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTRQ99707 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTRQ99707 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTRQ99707 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MTRQ99707 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTRQ99707 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTRQ99707 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTRQ99707 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MTRQ99707 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTRQ99707 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTRQ99707 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTRQ99707 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MTRQ99707 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTRQ99707 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MTRQ99707 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MTRQ99707 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MTRQ99707 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MTRQ99707 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTRQ99707 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTRQ99707 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTRQ99707 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTRQ99707 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTRQ99707 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms