Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LGMNQ99538 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LGMNQ99538 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LGMNQ99538 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGMNQ99538 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LGMNQ99538 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms