Protein–RNA interactions for Protein: Q99217

AMELX, Amelogenin, X isoform, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMELXQ99217 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMELXQ99217 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMELXQ99217 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMELXQ99217 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AMELXQ99217 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMELXQ99217 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMELXQ99217 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMELXQ99217 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.7 ms