Protein–RNA interactions for Protein: Q99217

AMELX, Amelogenin, X isoform, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMELXQ99217 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMELXQ99217 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMELXQ99217 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMELXQ99217 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AMELXQ99217 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMELXQ99217 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMELXQ99217 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMELXQ99217 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMELXQ99217 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMELXQ99217 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMELXQ99217 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMELXQ99217 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMELXQ99217 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMELXQ99217 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMELXQ99217 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMELXQ99217 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMELXQ99217 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMELXQ99217 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMELXQ99217 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMELXQ99217 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMELXQ99217 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMELXQ99217 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMELXQ99217 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMELXQ99217 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMELXQ99217 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMELXQ99217 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMELXQ99217 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMELXQ99217 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMELXQ99217 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMELXQ99217 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMELXQ99217 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMELXQ99217 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMELXQ99217 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMELXQ99217 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMELXQ99217 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMELXQ99217 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMELXQ99217 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMELXQ99217 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMELXQ99217 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMELXQ99217 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMELXQ99217 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMELXQ99217 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMELXQ99217 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMELXQ99217 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMELXQ99217 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMELXQ99217 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMELXQ99217 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMELXQ99217 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMELXQ99217 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMELXQ99217 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMELXQ99217 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMELXQ99217 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMELXQ99217 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AMELXQ99217 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AMELXQ99217 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AMELXQ99217 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AMELXQ99217 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AMELXQ99217 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AMELXQ99217 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMELXQ99217 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMELXQ99217 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMELXQ99217 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMELXQ99217 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMELXQ99217 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMELXQ99217 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMELXQ99217 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMELXQ99217 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMELXQ99217 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMELXQ99217 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMELXQ99217 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMELXQ99217 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMELXQ99217 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMELXQ99217 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMELXQ99217 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMELXQ99217 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMELXQ99217 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMELXQ99217 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMELXQ99217 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMELXQ99217 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMELXQ99217 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AMELXQ99217 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMELXQ99217 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMELXQ99217 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMELXQ99217 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMELXQ99217 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms