Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MMS19Q96T76 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMS19Q96T76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MMS19Q96T76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMS19Q96T76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MMS19Q96T76 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMS19Q96T76 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMS19Q96T76 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMS19Q96T76 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMS19Q96T76 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MMS19Q96T76 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MMS19Q96T76 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MMS19Q96T76 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMS19Q96T76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms