Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40CQ96S21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB40CQ96S21 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40CQ96S21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB40CQ96S21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40CQ96S21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB40CQ96S21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms