Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TGS1Q96RS0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TGS1Q96RS0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TGS1Q96RS0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TGS1Q96RS0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TGS1Q96RS0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TGS1Q96RS0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms