Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCNAQ96QF7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNAQ96QF7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNAQ96QF7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNAQ96QF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNAQ96QF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms