Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM74Q96NL1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM74Q96NL1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM74Q96NL1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM74Q96NL1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM74Q96NL1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM74Q96NL1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM74Q96NL1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM74Q96NL1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM74Q96NL1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM74Q96NL1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms