Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ1

Uncharacterized protein FLJ30774, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96NJ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q96NJ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q96NJ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q96NJ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q96NJ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q96NJ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q96NJ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q96NJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q96NJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q96NJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q96NJ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q96NJ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q96NJ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q96NJ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96NJ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96NJ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96NJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96NJ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96NJ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96NJ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96NJ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96NJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96NJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96NJ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96NJ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96NJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96NJ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96NJ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96NJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96NJ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96NJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q96NJ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q96NJ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q96NJ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q96NJ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q96NJ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q96NJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q96NJ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q96NJ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q96NJ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q96NJ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q96NJ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q96NJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q96NJ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q96NJ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q96NJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q96NJ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q96NJ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q96NJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q96NJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q96NJ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q96NJ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q96NJ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q96NJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q96NJ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q96NJ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q96NJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q96NJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q96NJ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q96NJ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q96NJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q96NJ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96NJ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96NJ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96NJ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96NJ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96NJ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96NJ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96NJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96NJ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96NJ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96NJ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96NJ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96NJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96NJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96NJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96NJ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96NJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96NJ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96NJ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96NJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96NJ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q96NJ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q96NJ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q96NJ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q96NJ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q96NJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q96NJ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q96NJ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms