Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN7L3BQ96GX2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN7L3BQ96GX2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN7L3BQ96GX2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATXN7L3BQ96GX2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN7L3BQ96GX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN7L3BQ96GX2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms