Protein–RNA interactions for Protein: Q96FB5

RRNAD1, Protein RRNAD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRNAD1Q96FB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRNAD1Q96FB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRNAD1Q96FB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRNAD1Q96FB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRNAD1Q96FB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms