Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN3Q96D15 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCN3Q96D15 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCN3Q96D15 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCN3Q96D15 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCN3Q96D15 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCN3Q96D15 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms