Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RCN3Q96D15 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RCN3Q96D15 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RCN3Q96D15 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RCN3Q96D15 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RCN3Q96D15 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RCN3Q96D15 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
RCN3Q96D15 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RCN3Q96D15 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RCN3Q96D15 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RCN3Q96D15 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RCN3Q96D15 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RCN3Q96D15 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RCN3Q96D15 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCN3Q96D15 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RCN3Q96D15 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RCN3Q96D15 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RCN3Q96D15 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RCN3Q96D15 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RCN3Q96D15 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RCN3Q96D15 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RCN3Q96D15 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RCN3Q96D15 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RCN3Q96D15 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RCN3Q96D15 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCN3Q96D15 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCN3Q96D15 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCN3Q96D15 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RCN3Q96D15 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RCN3Q96D15 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RCN3Q96D15 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCN3Q96D15 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCN3Q96D15 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCN3Q96D15 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCN3Q96D15 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCN3Q96D15 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCN3Q96D15 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCN3Q96D15 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCN3Q96D15 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCN3Q96D15 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCN3Q96D15 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCN3Q96D15 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCN3Q96D15 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCN3Q96D15 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCN3Q96D15 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCN3Q96D15 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCN3Q96D15 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCN3Q96D15 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCN3Q96D15 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCN3Q96D15 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCN3Q96D15 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCN3Q96D15 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCN3Q96D15 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RCN3Q96D15 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RCN3Q96D15 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCN3Q96D15 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCN3Q96D15 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCN3Q96D15 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCN3Q96D15 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCN3Q96D15 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCN3Q96D15 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCN3Q96D15 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCN3Q96D15 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCN3Q96D15 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCN3Q96D15 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCN3Q96D15 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCN3Q96D15 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCN3Q96D15 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCN3Q96D15 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCN3Q96D15 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCN3Q96D15 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCN3Q96D15 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCN3Q96D15 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCN3Q96D15 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCN3Q96D15 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCN3Q96D15 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCN3Q96D15 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCN3Q96D15 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCN3Q96D15 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCN3Q96D15 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCN3Q96D15 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCN3Q96D15 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCN3Q96D15 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCN3Q96D15 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCN3Q96D15 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCN3Q96D15 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCN3Q96D15 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCN3Q96D15 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCN3Q96D15 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCN3Q96D15 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCN3Q96D15 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCN3Q96D15 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCN3Q96D15 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms