Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFT1Q96AA3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFT1Q96AA3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFT1Q96AA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFT1Q96AA3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms