Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC2Q92769 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC2Q92769 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC2Q92769 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC2Q92769 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC2Q92769 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC2Q92769 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms