Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP205Q92621 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP205Q92621 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP205Q92621 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP205Q92621 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP205Q92621 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP205Q92621 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP205Q92621 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP205Q92621 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP205Q92621 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP205Q92621 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP205Q92621 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP205Q92621 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP205Q92621 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP205Q92621 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP205Q92621 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP205Q92621 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP205Q92621 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP205Q92621 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP205Q92621 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUP205Q92621 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP205Q92621 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP205Q92621 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP205Q92621 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP205Q92621 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP205Q92621 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms