Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CASKIN1Q8WXD9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CASKIN1Q8WXD9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CASKIN1Q8WXD9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CASKIN1Q8WXD9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CASKIN1Q8WXD9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CASKIN1Q8WXD9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CASKIN1Q8WXD9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CASKIN1Q8WXD9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CASKIN1Q8WXD9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CASKIN1Q8WXD9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CASKIN1Q8WXD9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CASKIN1Q8WXD9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CASKIN1Q8WXD9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CASKIN1Q8WXD9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CASKIN1Q8WXD9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CASKIN1Q8WXD9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CASKIN1Q8WXD9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CASKIN1Q8WXD9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CASKIN1Q8WXD9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CASKIN1Q8WXD9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms