Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GAB3Q8WWW8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GAB3Q8WWW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAB3Q8WWW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GAB3Q8WWW8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GAB3Q8WWW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAB3Q8WWW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAB3Q8WWW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAB3Q8WWW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms