Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A3Q8WWT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A3Q8WWT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A3Q8WWT9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC13A3Q8WWT9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC13A3Q8WWT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms