Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN6

SECTM1, Secreted and transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECTM1Q8WVN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SECTM1Q8WVN6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SECTM1Q8WVN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SECTM1Q8WVN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SECTM1Q8WVN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SECTM1Q8WVN6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SECTM1Q8WVN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215 ms