Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEST4Q8NFU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST4Q8NFU0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST4Q8NFU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BEST4Q8NFU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST4Q8NFU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST4Q8NFU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms