Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRFBP1Q8NEF9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRFBP1Q8NEF9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRFBP1Q8NEF9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRFBP1Q8NEF9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRFBP1Q8NEF9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRFBP1Q8NEF9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRFBP1Q8NEF9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFBP1Q8NEF9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRFBP1Q8NEF9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRFBP1Q8NEF9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFBP1Q8NEF9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms