Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MFSD2AQ8NA29 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MFSD2AQ8NA29 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MFSD2AQ8NA29 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MFSD2AQ8NA29 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MFSD2AQ8NA29 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms