Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM42Q8IWZ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM42Q8IWZ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM42Q8IWZ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM42Q8IWZ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM42Q8IWZ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM42Q8IWZ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms