Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE3

ZNF546, Zinc finger protein 546, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546Q86UE3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF546Q86UE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF546Q86UE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF546Q86UE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF546Q86UE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF546Q86UE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF546Q86UE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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